Từ khi thành lập, Trung tâm Khuyến nông Đắk Lắk bám sát các chương trình mục tiêu của tỉnh: Chương trình xóa đói giảm nghèo ưu tiên vào vùng đặc biệt khó khăn, vùng đồng bào dân tộc thiểu số, chương trình chuyển đổi cơ cấu sản xuất nông nghiệp theo hướng sản xuất hàng hoá, phát triển bền vững và nâng cao chất lượng sản phẩm nông nghiệp, chương trình xây dựng nông thôn mới,…